Antrenorul Cristian Achim a dorit să-i acorde încredere lui William Franklin, fundașul american accidentat în perioada de pregătire a sezonului anterior. Franklin a revenit la timp și a devenit titular la poziția 1 încă din primul meci oficial al noului sezon, susținut la Sibiu, în cadrul unui turneu de Cupa României. În plus, s-a consemnat debutul absolut al lui Daniel Dillon în baschetul românesc, respectiv debutul lui Ivan Stefanovic în echipamentul roș-albastru, după patru sezoane petrecute la Pitești.
Sezonul competițional 2012/13 a consemnat trecerea la nivelul următor pentru echipa de baschet CSM Oradea. Roș-albaștrii au început stagiunea în forță, câștigând 18 din primele 19 partide disputate în campionat. Bihorenii au staționat pe prima poziție a clasamentului la nivelul Ligii Naționale din prima până în penultima etapă a sezonului regulat. CSM-ul a terminat pe locul al 2-lea, după ce a pierdut ultimele două partide din sezonul regulat.
CSM Oradea a obținut primul succes într-un meci de playoff, după care a izbutit să câștige și prima serie de playoff. Bihorenii au avansat în semifinale, unde au cedat în fața Asesoftului, dar au terminat sezonul cu o victorie, pe locul al 3-lea, pentru primul podium din istoria clubului în campionat.
Lotul de jucători: William Franklin, Gediminas Navickas, Horia Hora, Nemanja Maric, Silviu Lupusavei, Daniel Dillon, Rareș Pașca, Zarko Comagic, Andrei Ciordaș, Ivan Stefanovic, Milos Pesic, Sasha Topcov, Laszlo Lazar, Bogdan Țibîrnă.
Gediminas Navickas s-a despărțit de CSM Oradea spre sfârșitul turului, în vreme ce Zarko Comagic a semnat cu formația bihoreană în partea a doua a sezonului regulat.
Sezonul regulat
| Etapa | Meci | Scor | Bilanț CSM |
| 1 | CSM Oradea vs BCM U Pitești | 69 – 66 | 1-0 (C) |
| 2 | Dinamo București vs CSM Oradea | 56 – 101 | 2-0 (C) |
| 3 | CSM Oradea vs CSU Sibiu | 67 – 58 | 3-0 (C) |
| 4 | BC Miercurea Ciuc vs CSM Oradea | 78 – 94 | 4-0 (C) |
| 5 | CSM Oradea vs BC Timișoara | 85 – 88 | 4-1 (P) |
| 6 | CSU Ploiești vs CSM Oradea | 85 – 94 | 5-1 (C) |
| 7 | CSM Oradea vs Gaz Metan Mediaș | 73 – 62 | 6-1 (C) |
| 8 | Timba Timișoara vs CSM Oradea | 62 – 83 | 7-1 (C) |
| 9 | CSM Oradea vs CSȘ Giurgiu | 80 – 70 | 8-1 (C) |
| 10 | Farul Constanța vs CSM Oradea | 57 – 101 | 9-1 (C) |
| 11 | CSM Oradea vs BC Mureș | 90 – 54 | 10-1 (C) |
| 12 | CSM București vs CSM Oradea | 61 – 77 | 11-1 (C) |
| 13 | CSM Oradea vs Energia Rovinari | 90 – 80 | 12-1 (C) |
| 14 | U Mobitelco Cluj vs CSM Oradea | 82 – 84 | 13-1 (C) |
| 15 | CSM Oradea vs SCM U Craiova | 83 – 74 | 14-1 (C) |
| 16 | BCM U Pitești vs CSM Oradea | 74 – 81 | 15-1 (C) |
| 17 | CSM Oradea vs Dinamo București | 105 – 55 | 16-1 (C) |
| 18 | CSU Sibiu vs CSM Oradea | 76 – 83 | 17-1 (C) |
| 19 | CSM Oradea vs BC Miercurea Ciuc | 81 – 59 | 18-1 (C) |
| 20 | BC Timișoara vs CSM Oradea | 63 – 56 | 18-2 (P) |
| 21 | CSM Oradea vs CSU Ploiești | 77 – 91 | 18-3 (P) |
| 22 | Gaz Metan Mediaș vs CSM Oradea | 71 – 64 | 18-4 (P) |
| 23 | CSM Oradea vs Timba Timișoara | 79 – 78 | 19-4 (C) |
| 24 | CSȘ Giurgiu vs CSM Oradea | 78 – 80 | 20-4 (C) |
| 25 | CSM Oradea vs Farul Constanța | 97 – 42 | 21-4 (C) |
| 26 | BC Mureș vs CSM Oradea | 81 – 48 | 21-5 (P) |
| 27 | CSM Oradea vs CSM București | 95 – 77 | 22-5 (C) |
| 28 | Energia Rovinari vs CSM Oradea | 63 – 78 | 23-5 (C) |
| 29 | CSM Oradea vs U Mobitelco Cluj | 75 – 84 | 23-6 (P) |
| 30 | SCM U Craiova vs CSM Oradea | 86 – 78 | 23-7 (P) |
– bilanț: 23 victorii, 7 înfrângeri.
– poziție: locul 2.
Playoff
| Meci | Turul I | Scor | Scor general | Bilanț CSM |
| M1 | CSM Oradea vs U Mobitelco Cluj | 77 – 63 | 1-0 (C) | 24-7 (C) |
| M2 | CSM Oradea vs U Mobitelco Cluj | 67 – 68 | 1-1 (P) | 24-8 (P) |
| M3 | U Mobitelco Cluj vs CSM Oradea | 64 – 72 | 2-1 (C) | 25-8 (C) |
| M4 | U Mobitelco Cluj vs CSM Oradea | 71 – 73 | 3-1 (C) | 26-8 (C) |
| Meci | Turul II | Scor | Scor general | Bilanț CSM |
| M1 | CSM Oradea vs CSU Ploiești | 80 – 60 | 1-0 (C) | 27-8 (C) |
| M2 | CSM Oradea vs CSU Ploiești | 90 – 91 | 1-1 (P) | 27-9 (P) |
| M3 | CSU Ploiești vs CSM Oradea | 86 – 68 | 1-2 (P) | 27-10 (P) |
| M4 | CSU Ploiești vs CSM Oradea | 85 – 72 | 1-3 (P) | 27-11 (P) |
| Meci | Finala mică | Scor | Scor general | Bilanț CSM |
| M1 | CSM Oradea vs Gaz Metan Mediaș | 73 – 68 | 1-0 (C) | 28-11 (C) |
| M2 | Gaz Metan Mediaș vs CSM Oradea | 79 – 72 | 1-1 (P) | 28-12 (P) |
| M3 | CSM Oradea vs Gaz Metan Mediaș | 88 – 83 | 2-1 (C) | 29-12 (C) |
– bilanț: 5 victorii, 4 înfrângeri.
– clasare: locul 3.
Cupa României
| Faza | Meci | Scor | Bilanț CSM |
| Tur 1 | BC Mureș vs CSM Oradea | 66-77 | 1-0 |
| Tur 1 | CSM Oradea vs BC Miercurea Ciuc | 82-43 | 2-0 |
| Tur 1 | Energia Rovinari vs CSM Oradea | 58-72 | 3-0 |
| Sferturi | CSM Oradea vs U-Mobitelco Cluj | 76-70 | 4-0 |
| Sferturi | U-Mobitelco Cluj vs CSM Oradea | 75-61 | 4-1 |
– bilanț: 4 victorii, o înfrângere